Ученые с нуля создали первый в истории связывающий молекулы белок
Исследователи впервые сделали прорыв, который поможет избежать десятков генетических заболеваний.
Ученые из Медицинской школы Вашингтонского университета разработали цилиндрический белок под названием «бета-баррель», который имеет полость для связывания с мишенью. Созданный белок способен связывать и активировать соединение, аналогично расположенное внутри зеленого флуоресцирующего белка.
«Это огромный шаг вперед для науки, где предыдущие попытки создания мелкомолекулярных связывающих белков были ограничены практикой белков, уже существующих в природе», - говорят ученые.
Этот недавний прорыв открывает двери ученым, способным создавать белки, не похожие ни на какие другие, найденные в природе. «Custom-designed» протеины можно сделать с высокой точностью и способностью связать и подействовать на специфических малых целях молекулы. Этот метод с нуля имеет потенциальные применения в исследованиях, медицине и промышленности.
«Успешный дизайн «de novo» изготовленных на заказ протеинов дают основу для творения все больше и больше изощренных белков, которые не будут иметь ограничений», - подчеркнул старший автор исследования Дэвид Бейкер.
Ученые с нуля создали первый в истории связывающий молекулы белок, который может лечить проблему алкоголизма. Для разработки нового белка ученый использовал программную платформу под названием Rosetta, разработанную в лаборатории Бейкера.
Программа может предсказать, какую форму цепь аминокислот примет после синтеза и может помочь в предсказывать как изменять индивидуальные аминокислоты вдоль цепи может изменить окончательную форму. Эта предсказательная способность позволяет тестировать различные комбинации аминокислот для разработки белка с желаемой формой и функцией. В дополнение к этому прогностическому программному обеспечению ученый использовал мощный новый алгоритм стыковки. «Не менее важно. Это значительно улучшает наше понимание детерминант сворачивания и связывания белков, помимо того, что мы узнали из описания существующих белковых структур», - сказал эксперт. Если все испытания пройдут успешно, то новинку можно будет использовать не только для лечения алкоголизма, но и других видов зависимости, говорят ученые.
