Ученые создали трехмерную карту ДНК мыши

Американские ученые из Кембриджского университета создали трехмерную карту ДНК клетки подопытной мыши. Подробнее об этом исследовании можно почитать на страницах специализированного издания Nature.

Эксперты опубликовали 3D-карту генома млекопитающих в отдельной клетке. На кадре видно, как вся ДНК клетки подопытного животного свернута внутри клеточного ядра.

Изначально специалисты изучили пространственную организацию генома у восьми эмбриональных стволовых клеток грызуна с одинарным набором хромосом. Было установлено, что ДНК создает несколько очень плотных образований.

Ученые выложили 3D-модель ДНК, в которой показано расположение контактирующих энхансеров с промоторами, ламин-ассоциированных доменов, которые являются участками хромосом, контактирующих с ядерной мембраной.

Для создания 3D-карты эксперты воспользовались Hi-C способом, который заключается в фиксации взаимодействующих участков ДНК с помощью формальдегида. Далее геном делят с образованием фрагментов, которые состоят из двух цепочек, сшитых белками. После ДНК объединяются и устанавливают нуклеотидную последовательность.